Bonsoir le Corse, et bienvenue sur le continent,

Concernant l'automatisation de l'extraction
Debenu vient de publier un nouveau plugin gratuit (Mac et Windows)
ARTS PDF Aerialist Lite qui a le bon goût d'ajouter un outil
Split dans les Actions.
Pour le reste il faut copier le code JavaScript et le coller dans une action
Exécuter le script JavaScript.
Dans Acrobat il n'y a pas moyen d'utiliser les plugins JavaScript dans les Actions, seuls les "vrais" plugins (en C++) y ont accès.