Votre application est sans doute basée sur une architecture PHP/mySQL/pddflib et, dans ce type de solution le moteur de l’application est le PHP qui génère du PDF via la classe pdflib (ou fpdf). C’est à ce niveau qu’il faut créer un nouveau programme PHP ou modifier l’existant afin d’automatiser le processus de création de vos documents PDF. Pour notre part, nous faisons cela souvent pour éditer des documents sous forme de formulaires (présentation identique au papier) à partir de données de bases mySQL saisies via des formulaires HTML/PHP…
Dans votre cas il suffit que votre client ait un acces dédié et sécurisé (via une interface Web) à votre base de données pour qu’il prépare ses éditions. Avec PHP, c’est un vrai bonheur que de réaliser ces choses là !